Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
COL16A1Q07092 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL16A1Q07092 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms