Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms