Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CENPEQ02224 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms