Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKL1Q00532 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKL1Q00532 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKL1Q00532 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKL1Q00532 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKL1Q00532 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKL1Q00532 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKL1Q00532 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKL1Q00532 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKL1Q00532 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKL1Q00532 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKL1Q00532 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKL1Q00532 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKL1Q00532 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKL1Q00532 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKL1Q00532 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKL1Q00532 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDKL1Q00532 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDKL1Q00532 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDKL1Q00532 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDKL1Q00532 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKL1Q00532 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms