Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAE1P78406 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAE1P78406 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAE1P78406 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAE1P78406 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAE1P78406 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAE1P78406 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAE1P78406 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAE1P78406 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAE1P78406 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAE1P78406 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAE1P78406 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAE1P78406 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAE1P78406 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAE1P78406 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAE1P78406 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAE1P78406 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAE1P78406 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAE1P78406 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAE1P78406 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAE1P78406 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAE1P78406 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAE1P78406 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAE1P78406 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAE1P78406 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAE1P78406 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAE1P78406 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAE1P78406 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAE1P78406 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAE1P78406 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAE1P78406 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAE1P78406 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAE1P78406 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAE1P78406 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAE1P78406 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAE1P78406 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAE1P78406 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAE1P78406 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAE1P78406 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAE1P78406 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAE1P78406 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAE1P78406 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAE1P78406 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAE1P78406 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAE1P78406 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAE1P78406 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAE1P78406 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAE1P78406 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAE1P78406 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAE1P78406 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAE1P78406 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAE1P78406 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAE1P78406 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAE1P78406 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAE1P78406 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAE1P78406 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAE1P78406 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAE1P78406 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAE1P78406 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAE1P78406 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAE1P78406 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAE1P78406 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAE1P78406 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAE1P78406 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAE1P78406 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAE1P78406 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAE1P78406 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAE1P78406 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAE1P78406 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAE1P78406 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAE1P78406 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAE1P78406 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAE1P78406 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAE1P78406 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAE1P78406 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAE1P78406 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAE1P78406 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAE1P78406 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAE1P78406 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAE1P78406 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAE1P78406 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAE1P78406 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAE1P78406 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAE1P78406 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAE1P78406 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAE1P78406 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAE1P78406 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAE1P78406 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAE1P78406 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAE1P78406 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAE1P78406 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAE1P78406 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAE1P78406 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAE1P78406 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAE1P78406 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAE1P78406 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAE1P78406 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAE1P78406 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAE1P78406 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAE1P78406 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms