Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms