Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms