Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UFM1P61960 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UFM1P61960 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UFM1P61960 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UFM1P61960 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UFM1P61960 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UFM1P61960 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UFM1P61960 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UFM1P61960 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UFM1P61960 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UFM1P61960 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UFM1P61960 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UFM1P61960 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UFM1P61960 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UFM1P61960 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UFM1P61960 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UFM1P61960 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UFM1P61960 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UFM1P61960 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UFM1P61960 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UFM1P61960 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UFM1P61960 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UFM1P61960 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UFM1P61960 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UFM1P61960 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UFM1P61960 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UFM1P61960 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UFM1P61960 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UFM1P61960 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UFM1P61960 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UFM1P61960 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UFM1P61960 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UFM1P61960 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UFM1P61960 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UFM1P61960 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UFM1P61960 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UFM1P61960 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UFM1P61960 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UFM1P61960 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UFM1P61960 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UFM1P61960 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UFM1P61960 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UFM1P61960 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UFM1P61960 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UFM1P61960 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UFM1P61960 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UFM1P61960 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UFM1P61960 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UFM1P61960 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UFM1P61960 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UFM1P61960 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UFM1P61960 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UFM1P61960 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UFM1P61960 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UFM1P61960 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UFM1P61960 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms