Protein–RNA interactions for Protein: P61073

CXCR4, C-X-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR4P61073 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CXCR4P61073 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms