Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACTBP60709 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACTBP60709 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACTBP60709 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACTBP60709 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACTBP60709 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACTBP60709 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACTBP60709 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACTBP60709 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACTBP60709 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACTBP60709 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACTBP60709 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACTBP60709 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACTBP60709 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACTBP60709 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACTBP60709 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACTBP60709 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACTBP60709 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ACTBP60709 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTBP60709 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTBP60709 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTBP60709 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTBP60709 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTBP60709 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTBP60709 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTBP60709 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTBP60709 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTBP60709 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTBP60709 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTBP60709 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTBP60709 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTBP60709 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTBP60709 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTBP60709 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTBP60709 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTBP60709 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTBP60709 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTBP60709 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTBP60709 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTBP60709 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTBP60709 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTBP60709 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTBP60709 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTBP60709 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTBP60709 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTBP60709 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTBP60709 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTBP60709 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTBP60709 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTBP60709 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTBP60709 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTBP60709 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTBP60709 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTBP60709 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTBP60709 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTBP60709 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTBP60709 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTBP60709 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTBP60709 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTBP60709 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTBP60709 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTBP60709 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTBP60709 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTBP60709 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTBP60709 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTBP60709 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTBP60709 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTBP60709 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTBP60709 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTBP60709 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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ACTBP60709 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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ACTBP60709 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTBP60709 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTBP60709 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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ACTBP60709 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTBP60709 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTBP60709 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTBP60709 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTBP60709 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTBP60709 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTBP60709 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTBP60709 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTBP60709 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTBP60709 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTBP60709 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTBP60709 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTBP60709 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTBP60709 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTBP60709 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTBP60709 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTBP60709 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTBP60709 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTBP60709 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTBP60709 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTBP60709 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTBP60709 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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