Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPAP53621 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPAP53621 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPAP53621 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPAP53621 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPAP53621 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPAP53621 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPAP53621 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPAP53621 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPAP53621 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPAP53621 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPAP53621 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPAP53621 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPAP53621 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPAP53621 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPAP53621 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPAP53621 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPAP53621 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPAP53621 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPAP53621 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPAP53621 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPAP53621 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPAP53621 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPAP53621 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPAP53621 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPAP53621 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPAP53621 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
COPAP53621 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
COPAP53621 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPAP53621 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPAP53621 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPAP53621 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPAP53621 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPAP53621 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPAP53621 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPAP53621 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPAP53621 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPAP53621 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPAP53621 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPAP53621 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
COPAP53621 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
COPAP53621 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPAP53621 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPAP53621 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPAP53621 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPAP53621 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPAP53621 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPAP53621 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPAP53621 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPAP53621 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPAP53621 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPAP53621 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPAP53621 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPAP53621 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPAP53621 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPAP53621 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COPAP53621 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPAP53621 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPAP53621 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPAP53621 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPAP53621 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPAP53621 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPAP53621 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPAP53621 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPAP53621 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPAP53621 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COPAP53621 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPAP53621 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPAP53621 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPAP53621 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPAP53621 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COPAP53621 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPAP53621 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPAP53621 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPAP53621 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPAP53621 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPAP53621 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPAP53621 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPAP53621 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPAP53621 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
COPAP53621 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPAP53621 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
COPAP53621 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPAP53621 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPAP53621 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPAP53621 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPAP53621 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPAP53621 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPAP53621 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPAP53621 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPAP53621 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPAP53621 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPAP53621 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
COPAP53621 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPAP53621 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPAP53621 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPAP53621 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPAP53621 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPAP53621 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
COPAP53621 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms