Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARFIP1P53367 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms