Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PGDP52209 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGDP52209 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms