Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPC3P51654 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPC3P51654 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPC3P51654 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GPC3P51654 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC3P51654 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC3P51654 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC3P51654 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC3P51654 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC3P51654 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC3P51654 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC3P51654 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC3P51654 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC3P51654 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC3P51654 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC3P51654 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC3P51654 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC3P51654 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC3P51654 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC3P51654 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC3P51654 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC3P51654 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC3P51654 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC3P51654 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC3P51654 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC3P51654 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC3P51654 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC3P51654 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC3P51654 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC3P51654 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC3P51654 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC3P51654 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC3P51654 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC3P51654 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC3P51654 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC3P51654 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC3P51654 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC3P51654 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC3P51654 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GPC3P51654 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPC3P51654 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPC3P51654 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPC3P51654 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPC3P51654 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPC3P51654 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPC3P51654 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GPC3P51654 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC3P51654 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC3P51654 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC3P51654 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC3P51654 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC3P51654 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC3P51654 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC3P51654 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC3P51654 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC3P51654 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC3P51654 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC3P51654 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC3P51654 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC3P51654 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC3P51654 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC3P51654 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC3P51654 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC3P51654 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC3P51654 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC3P51654 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC3P51654 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC3P51654 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC3P51654 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC3P51654 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC3P51654 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC3P51654 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC3P51654 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC3P51654 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC3P51654 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC3P51654 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC3P51654 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC3P51654 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC3P51654 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC3P51654 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC3P51654 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC3P51654 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC3P51654 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC3P51654 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GPC3P51654 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC3P51654 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC3P51654 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC3P51654 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC3P51654 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC3P51654 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC3P51654 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC3P51654 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC3P51654 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC3P51654 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC3P51654 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC3P51654 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC3P51654 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC3P51654 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC3P51654 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC3P51654 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms