Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SMARCA2P51531 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms