Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB28P51157 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB28P51157 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB28P51157 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB28P51157 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB28P51157 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB28P51157 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB28P51157 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB28P51157 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB28P51157 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB28P51157 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB28P51157 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB28P51157 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB28P51157 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB28P51157 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB28P51157 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB28P51157 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB28P51157 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB28P51157 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB28P51157 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB28P51157 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB28P51157 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB28P51157 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB28P51157 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB28P51157 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB28P51157 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB28P51157 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB28P51157 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB28P51157 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB28P51157 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB28P51157 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB28P51157 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB28P51157 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB28P51157 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB28P51157 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB28P51157 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB28P51157 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB28P51157 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB28P51157 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB28P51157 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB28P51157 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB28P51157 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB28P51157 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB28P51157 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB28P51157 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB28P51157 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB28P51157 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB28P51157 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB28P51157 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB28P51157 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB28P51157 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB28P51157 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB28P51157 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms