Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IDH3AP50213 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms