Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP153P49790 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP153P49790 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP153P49790 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP153P49790 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP153P49790 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP153P49790 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP153P49790 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP153P49790 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP153P49790 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP153P49790 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP153P49790 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP153P49790 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP153P49790 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP153P49790 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP153P49790 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP153P49790 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP153P49790 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP153P49790 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP153P49790 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP153P49790 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP153P49790 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP153P49790 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP153P49790 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP153P49790 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP153P49790 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP153P49790 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP153P49790 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NUP153P49790 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NUP153P49790 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NUP153P49790 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NUP153P49790 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NUP153P49790 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NUP153P49790 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NUP153P49790 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NUP153P49790 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NUP153P49790 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NUP153P49790 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP153P49790 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP153P49790 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP153P49790 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP153P49790 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP153P49790 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP153P49790 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP153P49790 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP153P49790 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP153P49790 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP153P49790 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP153P49790 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP153P49790 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP153P49790 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP153P49790 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP153P49790 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP153P49790 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP153P49790 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP153P49790 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP153P49790 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP153P49790 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP153P49790 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP153P49790 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP153P49790 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP153P49790 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP153P49790 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP153P49790 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP153P49790 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP153P49790 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP153P49790 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP153P49790 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP153P49790 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP153P49790 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP153P49790 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP153P49790 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP153P49790 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP153P49790 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP153P49790 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP153P49790 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP153P49790 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP153P49790 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP153P49790 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP153P49790 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP153P49790 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP153P49790 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP153P49790 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP153P49790 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP153P49790 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP153P49790 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP153P49790 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP153P49790 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP153P49790 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP153P49790 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP153P49790 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP153P49790 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP153P49790 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP153P49790 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP153P49790 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP153P49790 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP153P49790 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP153P49790 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP153P49790 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP153P49790 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms