Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA4P48169 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms