Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGIRP43119 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms