Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GDF5P43026 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDF5P43026 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDF5P43026 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDF5P43026 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDF5P43026 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDF5P43026 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDF5P43026 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDF5P43026 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDF5P43026 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDF5P43026 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDF5P43026 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDF5P43026 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GDF5P43026 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDF5P43026 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GDF5P43026 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDF5P43026 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDF5P43026 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDF5P43026 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GDF5P43026 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDF5P43026 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDF5P43026 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDF5P43026 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GDF5P43026 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF5P43026 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF5P43026 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF5P43026 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF5P43026 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF5P43026 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF5P43026 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF5P43026 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF5P43026 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF5P43026 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF5P43026 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF5P43026 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF5P43026 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF5P43026 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF5P43026 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF5P43026 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF5P43026 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF5P43026 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF5P43026 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF5P43026 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF5P43026 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF5P43026 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF5P43026 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF5P43026 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF5P43026 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF5P43026 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF5P43026 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF5P43026 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF5P43026 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF5P43026 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF5P43026 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF5P43026 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF5P43026 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF5P43026 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF5P43026 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF5P43026 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF5P43026 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF5P43026 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDF5P43026 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF5P43026 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF5P43026 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF5P43026 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF5P43026 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF5P43026 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF5P43026 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF5P43026 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF5P43026 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF5P43026 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF5P43026 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF5P43026 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF5P43026 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF5P43026 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF5P43026 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF5P43026 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF5P43026 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF5P43026 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF5P43026 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF5P43026 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF5P43026 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF5P43026 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF5P43026 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF5P43026 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF5P43026 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF5P43026 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF5P43026 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF5P43026 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF5P43026 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF5P43026 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF5P43026 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF5P43026 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF5P43026 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF5P43026 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF5P43026 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF5P43026 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF5P43026 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDF5P43026 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDF5P43026 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms