Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NSG1P42857 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NSG1P42857 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NSG1P42857 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NSG1P42857 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NSG1P42857 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NSG1P42857 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NSG1P42857 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NSG1P42857 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSG1P42857 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSG1P42857 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSG1P42857 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSG1P42857 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSG1P42857 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSG1P42857 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSG1P42857 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSG1P42857 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NSG1P42857 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSG1P42857 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSG1P42857 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSG1P42857 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSG1P42857 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NSG1P42857 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NSG1P42857 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSG1P42857 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSG1P42857 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSG1P42857 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSG1P42857 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSG1P42857 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NSG1P42857 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSG1P42857 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSG1P42857 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSG1P42857 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSG1P42857 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSG1P42857 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSG1P42857 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSG1P42857 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSG1P42857 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NSG1P42857 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSG1P42857 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSG1P42857 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSG1P42857 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSG1P42857 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSG1P42857 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSG1P42857 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSG1P42857 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSG1P42857 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSG1P42857 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSG1P42857 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSG1P42857 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSG1P42857 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSG1P42857 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSG1P42857 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSG1P42857 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSG1P42857 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSG1P42857 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSG1P42857 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSG1P42857 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NSG1P42857 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSG1P42857 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSG1P42857 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSG1P42857 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NSG1P42857 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NSG1P42857 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSG1P42857 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSG1P42857 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSG1P42857 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSG1P42857 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSG1P42857 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSG1P42857 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSG1P42857 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSG1P42857 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSG1P42857 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSG1P42857 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NSG1P42857 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSG1P42857 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSG1P42857 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSG1P42857 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSG1P42857 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSG1P42857 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSG1P42857 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSG1P42857 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSG1P42857 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSG1P42857 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSG1P42857 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSG1P42857 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSG1P42857 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSG1P42857 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSG1P42857 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSG1P42857 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NSG1P42857 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSG1P42857 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSG1P42857 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSG1P42857 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSG1P42857 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSG1P42857 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSG1P42857 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSG1P42857 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NSG1P42857 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NSG1P42857 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms