Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5C1P36542 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms