Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNB1P35222 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms