Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP5DP30049 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms