Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRB3P28472 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms