Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLD1P28340 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLD1P28340 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
POLD1P28340 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
POLD1P28340 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLD1P28340 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLD1P28340 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLD1P28340 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
POLD1P28340 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLD1P28340 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
POLD1P28340 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLD1P28340 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLD1P28340 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLD1P28340 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLD1P28340 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLD1P28340 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLD1P28340 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLD1P28340 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLD1P28340 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLD1P28340 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLD1P28340 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLD1P28340 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLD1P28340 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLD1P28340 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLD1P28340 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLD1P28340 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLD1P28340 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLD1P28340 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLD1P28340 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLD1P28340 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLD1P28340 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLD1P28340 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLD1P28340 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLD1P28340 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLD1P28340 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD1P28340 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD1P28340 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD1P28340 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD1P28340 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD1P28340 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD1P28340 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD1P28340 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD1P28340 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD1P28340 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD1P28340 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD1P28340 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD1P28340 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD1P28340 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD1P28340 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD1P28340 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD1P28340 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD1P28340 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD1P28340 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD1P28340 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD1P28340 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD1P28340 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD1P28340 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD1P28340 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD1P28340 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD1P28340 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD1P28340 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD1P28340 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD1P28340 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
POLD1P28340 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD1P28340 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD1P28340 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD1P28340 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD1P28340 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD1P28340 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD1P28340 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD1P28340 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD1P28340 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD1P28340 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD1P28340 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD1P28340 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD1P28340 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD1P28340 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD1P28340 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD1P28340 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD1P28340 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD1P28340 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD1P28340 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD1P28340 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD1P28340 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD1P28340 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD1P28340 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD1P28340 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD1P28340 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD1P28340 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD1P28340 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD1P28340 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD1P28340 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD1P28340 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD1P28340 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD1P28340 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD1P28340 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD1P28340 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD1P28340 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD1P28340 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLD1P28340 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms