Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA2P26232 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms