Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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