Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHCGRP22888 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms