Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1BP22528 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms