Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD247P20963 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD247P20963 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD247P20963 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD247P20963 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD247P20963 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD247P20963 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD247P20963 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD247P20963 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CD247P20963 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD247P20963 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD247P20963 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD247P20963 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD247P20963 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD247P20963 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD247P20963 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD247P20963 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD247P20963 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CD247P20963 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD247P20963 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD247P20963 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD247P20963 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CD247P20963 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD247P20963 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD247P20963 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD247P20963 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD247P20963 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD247P20963 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD247P20963 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD247P20963 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD247P20963 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD247P20963 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD247P20963 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD247P20963 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD247P20963 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD247P20963 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD247P20963 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD247P20963 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD247P20963 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CD247P20963 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD247P20963 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD247P20963 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD247P20963 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD247P20963 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD247P20963 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD247P20963 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD247P20963 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD247P20963 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD247P20963 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD247P20963 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD247P20963 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD247P20963 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD247P20963 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD247P20963 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD247P20963 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD247P20963 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD247P20963 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD247P20963 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD247P20963 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD247P20963 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD247P20963 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD247P20963 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CD247P20963 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD247P20963 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CD247P20963 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD247P20963 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD247P20963 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD247P20963 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD247P20963 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD247P20963 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD247P20963 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD247P20963 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CD247P20963 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD247P20963 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD247P20963 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD247P20963 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CD247P20963 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CD247P20963 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD247P20963 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD247P20963 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD247P20963 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD247P20963 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD247P20963 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD247P20963 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD247P20963 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD247P20963 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD247P20963 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD247P20963 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD247P20963 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD247P20963 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD247P20963 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD247P20963 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD247P20963 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD247P20963 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD247P20963 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD247P20963 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD247P20963 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD247P20963 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD247P20963 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD247P20963 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms