Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NTF3P20783 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NTF3P20783 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms