Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CCL3L1P16619 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CCL3L1P16619 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CCL3L1P16619 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CCL3L1P16619 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CCL3L1P16619 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CCL3L1P16619 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CCL3L1P16619 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CCL3L1P16619 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CCL3L1P16619 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CCL3L1P16619 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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CCL3L1P16619 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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CCL3L1P16619 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCL3L1P16619 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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