Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFTRP13569 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFTRP13569 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFTRP13569 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFTRP13569 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFTRP13569 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFTRP13569 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFTRP13569 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CFTRP13569 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFTRP13569 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFTRP13569 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFTRP13569 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFTRP13569 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFTRP13569 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFTRP13569 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFTRP13569 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFTRP13569 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFTRP13569 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFTRP13569 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFTRP13569 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFTRP13569 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFTRP13569 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFTRP13569 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFTRP13569 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFTRP13569 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CFTRP13569 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFTRP13569 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFTRP13569 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFTRP13569 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CFTRP13569 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFTRP13569 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFTRP13569 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFTRP13569 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFTRP13569 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFTRP13569 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFTRP13569 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFTRP13569 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFTRP13569 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFTRP13569 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CFTRP13569 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFTRP13569 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFTRP13569 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFTRP13569 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFTRP13569 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFTRP13569 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFTRP13569 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFTRP13569 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFTRP13569 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFTRP13569 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFTRP13569 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFTRP13569 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFTRP13569 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFTRP13569 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CFTRP13569 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CFTRP13569 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CFTRP13569 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFTRP13569 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFTRP13569 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFTRP13569 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFTRP13569 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFTRP13569 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFTRP13569 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CFTRP13569 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFTRP13569 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFTRP13569 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFTRP13569 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFTRP13569 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFTRP13569 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFTRP13569 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CFTRP13569 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CFTRP13569 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CFTRP13569 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CFTRP13569 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFTRP13569 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFTRP13569 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CFTRP13569 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFTRP13569 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFTRP13569 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFTRP13569 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFTRP13569 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CFTRP13569 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFTRP13569 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFTRP13569 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFTRP13569 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFTRP13569 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFTRP13569 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFTRP13569 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFTRP13569 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFTRP13569 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFTRP13569 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFTRP13569 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFTRP13569 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFTRP13569 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFTRP13569 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CFTRP13569 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFTRP13569 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFTRP13569 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFTRP13569 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFTRP13569 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CFTRP13569 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms