Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHRNB1P11230 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms