Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC159P0C7I6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms