Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB1P08034 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB1P08034 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB1P08034 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB1P08034 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB1P08034 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB1P08034 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB1P08034 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB1P08034 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB1P08034 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB1P08034 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB1P08034 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB1P08034 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB1P08034 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB1P08034 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB1P08034 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB1P08034 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB1P08034 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB1P08034 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB1P08034 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB1P08034 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB1P08034 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB1P08034 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB1P08034 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB1P08034 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB1P08034 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB1P08034 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB1P08034 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB1P08034 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB1P08034 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB1P08034 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB1P08034 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB1P08034 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB1P08034 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB1P08034 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB1P08034 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB1P08034 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB1P08034 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB1P08034 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB1P08034 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB1P08034 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB1P08034 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB1P08034 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB1P08034 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB1P08034 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB1P08034 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB1P08034 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB1P08034 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB1P08034 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB1P08034 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB1P08034 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB1P08034 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB1P08034 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB1P08034 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB1P08034 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB1P08034 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB1P08034 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB1P08034 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB1P08034 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB1P08034 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB1P08034 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB1P08034 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB1P08034 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB1P08034 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB1P08034 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB1P08034 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB1P08034 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB1P08034 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB1P08034 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB1P08034 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB1P08034 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB1P08034 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB1P08034 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB1P08034 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB1P08034 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB1P08034 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB1P08034 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB1P08034 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB1P08034 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB1P08034 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB1P08034 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB1P08034 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB1P08034 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB1P08034 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB1P08034 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB1P08034 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB1P08034 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB1P08034 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB1P08034 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB1P08034 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB1P08034 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB1P08034 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB1P08034 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB1P08034 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB1P08034 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB1P08034 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB1P08034 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJB1P08034 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJB1P08034 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GJB1P08034 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms