Protein–RNA interactions for Protein: P07988

SFTPB, Pulmonary surfactant-associated protein B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPBP07988 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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SFTPBP07988 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SFTPBP07988 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SFTPBP07988 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SFTPBP07988 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFTPBP07988 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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