Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CYBBP04839 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYBBP04839 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYBBP04839 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYBBP04839 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYBBP04839 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CYBBP04839 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYBBP04839 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CYBBP04839 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CYBBP04839 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYBBP04839 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYBBP04839 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYBBP04839 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYBBP04839 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYBBP04839 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYBBP04839 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYBBP04839 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYBBP04839 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYBBP04839 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYBBP04839 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYBBP04839 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYBBP04839 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYBBP04839 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYBBP04839 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYBBP04839 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CYBBP04839 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYBBP04839 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYBBP04839 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CYBBP04839 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYBBP04839 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYBBP04839 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYBBP04839 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYBBP04839 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYBBP04839 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYBBP04839 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYBBP04839 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYBBP04839 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYBBP04839 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CYBBP04839 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYBBP04839 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYBBP04839 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYBBP04839 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CYBBP04839 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CYBBP04839 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYBBP04839 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CYBBP04839 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CYBBP04839 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CYBBP04839 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYBBP04839 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYBBP04839 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CYBBP04839 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CYBBP04839 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CYBBP04839 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CYBBP04839 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYBBP04839 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYBBP04839 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYBBP04839 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYBBP04839 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYBBP04839 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYBBP04839 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYBBP04839 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYBBP04839 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYBBP04839 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYBBP04839 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYBBP04839 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CYBBP04839 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYBBP04839 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYBBP04839 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYBBP04839 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYBBP04839 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYBBP04839 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYBBP04839 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYBBP04839 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYBBP04839 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYBBP04839 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYBBP04839 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYBBP04839 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYBBP04839 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYBBP04839 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYBBP04839 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYBBP04839 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYBBP04839 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYBBP04839 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYBBP04839 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CYBBP04839 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CYBBP04839 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYBBP04839 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYBBP04839 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYBBP04839 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYBBP04839 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYBBP04839 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYBBP04839 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYBBP04839 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYBBP04839 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYBBP04839 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYBBP04839 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYBBP04839 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYBBP04839 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYBBP04839 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CYBBP04839 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms