Protein–RNA interactions for Protein: O95460

MATN4, Matrilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN4O95460 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MATN4O95460 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MATN4O95460 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MATN4O95460 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MATN4O95460 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MATN4O95460 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MATN4O95460 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MATN4O95460 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MATN4O95460 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MATN4O95460 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MATN4O95460 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MATN4O95460 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MATN4O95460 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MATN4O95460 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MATN4O95460 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MATN4O95460 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MATN4O95460 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MATN4O95460 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MATN4O95460 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MATN4O95460 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MATN4O95460 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MATN4O95460 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MATN4O95460 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MATN4O95460 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MATN4O95460 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MATN4O95460 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MATN4O95460 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MATN4O95460 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MATN4O95460 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MATN4O95460 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MATN4O95460 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MATN4O95460 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MATN4O95460 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MATN4O95460 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MATN4O95460 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MATN4O95460 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MATN4O95460 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MATN4O95460 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MATN4O95460 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MATN4O95460 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MATN4O95460 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MATN4O95460 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MATN4O95460 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MATN4O95460 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MATN4O95460 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MATN4O95460 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MATN4O95460 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MATN4O95460 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MATN4O95460 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MATN4O95460 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MATN4O95460 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MATN4O95460 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MATN4O95460 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MATN4O95460 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MATN4O95460 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MATN4O95460 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms