Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SCN2BO60939 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SCN2BO60939 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SCN2BO60939 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SCN2BO60939 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SCN2BO60939 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SCN2BO60939 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN2BO60939 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCN2BO60939 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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