Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CXCL13O43927 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CXCL13O43927 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CXCL13O43927 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CXCL13O43927 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CXCL13O43927 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CXCL13O43927 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CXCL13O43927 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CXCL13O43927 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CXCL13O43927 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CXCL13O43927 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CXCL13O43927 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CXCL13O43927 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CXCL13O43927 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CXCL13O43927 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CXCL13O43927 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CXCL13O43927 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CXCL13O43927 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CXCL13O43927 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CXCL13O43927 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CXCL13O43927 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CXCL13O43927 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CXCL13O43927 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CXCL13O43927 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CXCL13O43927 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CXCL13O43927 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CXCL13O43927 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CXCL13O43927 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CXCL13O43927 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CXCL13O43927 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CXCL13O43927 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CXCL13O43927 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CXCL13O43927 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CXCL13O43927 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CXCL13O43927 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CXCL13O43927 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms