Protein–RNA interactions for Protein: O43734

TRAF3IP2, Adapter protein CIKS, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2O43734 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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TRAF3IP2O43734 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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TRAF3IP2O43734 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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TRAF3IP2O43734 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAF3IP2O43734 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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