Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF1O43189 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF1O43189 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHF1O43189 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHF1O43189 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHF1O43189 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHF1O43189 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHF1O43189 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHF1O43189 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHF1O43189 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PHF1O43189 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHF1O43189 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHF1O43189 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHF1O43189 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHF1O43189 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF1O43189 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF1O43189 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF1O43189 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF1O43189 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF1O43189 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF1O43189 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF1O43189 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF1O43189 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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