Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLOCKO15516 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms