Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP290O15078 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP290O15078 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP290O15078 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP290O15078 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP290O15078 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP290O15078 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP290O15078 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP290O15078 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP290O15078 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP290O15078 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP290O15078 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP290O15078 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP290O15078 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP290O15078 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP290O15078 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP290O15078 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP290O15078 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP290O15078 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP290O15078 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP290O15078 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP290O15078 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP290O15078 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP290O15078 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP290O15078 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP290O15078 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP290O15078 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP290O15078 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP290O15078 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP290O15078 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP290O15078 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP290O15078 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP290O15078 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP290O15078 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP290O15078 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP290O15078 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP290O15078 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP290O15078 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP290O15078 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP290O15078 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP290O15078 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP290O15078 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP290O15078 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP290O15078 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP290O15078 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP290O15078 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP290O15078 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP290O15078 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP290O15078 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP290O15078 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP290O15078 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP290O15078 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP290O15078 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP290O15078 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP290O15078 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP290O15078 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP290O15078 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP290O15078 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP290O15078 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP290O15078 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP290O15078 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP290O15078 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP290O15078 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP290O15078 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP290O15078 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP290O15078 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP290O15078 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP290O15078 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP290O15078 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP290O15078 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP290O15078 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP290O15078 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP290O15078 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP290O15078 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP290O15078 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP290O15078 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP290O15078 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP290O15078 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP290O15078 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP290O15078 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP290O15078 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP290O15078 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP290O15078 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP290O15078 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP290O15078 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP290O15078 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP290O15078 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP290O15078 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP290O15078 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP290O15078 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP290O15078 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP290O15078 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP290O15078 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP290O15078 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP290O15078 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP290O15078 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP290O15078 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP290O15078 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP290O15078 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP290O15078 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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