Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNMO15061 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNMO15061 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNMO15061 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNMO15061 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNMO15061 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNMO15061 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNMO15061 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNMO15061 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNMO15061 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNMO15061 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNMO15061 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNMO15061 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNMO15061 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNMO15061 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNMO15061 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNMO15061 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNMO15061 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNMO15061 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNMO15061 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNMO15061 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNMO15061 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNMO15061 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNMO15061 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNMO15061 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNMO15061 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNMO15061 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNMO15061 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNMO15061 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNMO15061 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNMO15061 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNMO15061 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNMO15061 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNMO15061 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNMO15061 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNMO15061 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNMO15061 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNMO15061 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNMO15061 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNMO15061 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNMO15061 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNMO15061 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNMO15061 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNMO15061 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNMO15061 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNMO15061 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNMO15061 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNMO15061 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNMO15061 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNMO15061 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNMO15061 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNMO15061 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNMO15061 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNMO15061 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNMO15061 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNMO15061 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNMO15061 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNMO15061 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNMO15061 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNMO15061 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNMO15061 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNMO15061 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNMO15061 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNMO15061 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNMO15061 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNMO15061 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNMO15061 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNMO15061 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNMO15061 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNMO15061 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNMO15061 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNMO15061 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNMO15061 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNMO15061 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNMO15061 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNMO15061 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNMO15061 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNMO15061 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNMO15061 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNMO15061 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNMO15061 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNMO15061 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNMO15061 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNMO15061 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNMO15061 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNMO15061 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNMO15061 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNMO15061 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNMO15061 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNMO15061 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNMO15061 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNMO15061 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNMO15061 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNMO15061 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNMO15061 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNMO15061 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNMO15061 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNMO15061 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNMO15061 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNMO15061 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms