Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms