Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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